公路工程管理系統和公路運輸管理系統是兩個不相統屬的系統，但又是彼此有密切關系的系統。比如，汽車運輸要開辟或加強改善某些路線的客貨運輸，必須預先調查研究沿線的客貨來源、種類、運量、地點、季節等等，為此向工程部門提出工程的要求和指標。工程部門則研究滿足這些要求的方法和措施，為運輸服務。那么，究竟是先有公路然后考慮組織運輸，還是先考慮運輸需要來修建公路呢？一般講，按后者安排為好。但有時也應根據具體情況，全面分析，決定對策。這個問題在國際公路論壇中是經常遇到的。有些國家已把運輸工程和工程經濟列為專業課程，在大學講授。這是關系到公路發展的宏觀經濟、影響全局的問題，在公路管理中值得重視。
　　公路工程方案在實施過程中，工程管理部門應根據需要完成項目的先后順序，編制分項工程進度表，然后根據各項進度排出總的進度表，并注意各分項工程之間不得互相干擾。如遇情況變化，應及時作相應修改。進度表是執行計劃的指導綱領。某一環節不按計劃進行就有可能打亂局部，甚至是全局的安排。執行計劃包括內容繁多，主要方面有：施工前需補充的測量放樣、材料供應和試驗、機具配備和維修、運輸工具的配備和維修、勞動力組織和調配、技工培訓和考核、水電供應、工地安全設施、工地應急設施、醫療衛生、職工生活、工程定額和進度的統計分析、財務管理等等。工地既要有分項管理人員，又要有全面管理的人員。